バイオ研究機器のBioLab(バイオラボ) TOP > 商品案内 > ゲノミクス > 全自動キャピラリー電気泳動システム

全自動キャピラリー電気泳動システム パンフレット

全自動キャピラリー電気泳動システム

55cmキャピラリーの採用

一般的な核酸チップ電気泳動システムは、わずか数cmのマイクロ流路内で分離するため、分離能に限界があります。Fragment Analyzerは、55cm長(ロングタイプ:80cm)のキャピラリーを採用しており、非常に高い分離能とサイズ正確性を持ち合わせています。
 シャープなエレクトロフェログラムが得られるため、近接したバンドもしっかり分離でき、SSRなどの変異解析にも対応しています。

また、Fragment Analyzerは1~100,000bpまでの広い分画レンジを持っています。これにより他社製品では解析が困難であった、長いDNA鎖の解析が可能であり、ロングリードモデルの次世代シークエンサー(NGS)やNGSを使用した長鎖メイトペアシークエンスのライブラリー調整に対応します。
 左図はDNA Sharing装置にてゲノムDNAを10kbpの断片化したサンプルの泳動図です。スメアの裾がアッパーマーカー(UM)に重なることなく、正確な解析が可能です。

ハイスループット

96本のパラレルキャピラリーを採用することにより、一度に多くのサンプルを短時間で解析します。96サンプルの解析時間は1時間弱です(96本キャピラリー使用時)。RNAなどの分解しやすいサンプルに対しても、1番目から96番目のサンプルを同時に解析するため、分解によるデータのバラつきがありません。
また、96ウェルプレートを3枚、ゲルを2種類までセットでき、1バッチで2種類のアプリケーションで最大288サンプルまで解析が可能です。ゲルやサンプルプレートはラン中でもセットできるため、前の実験が終わるまで待つ必要はありません。

高感度

自動核酸電気泳動装置ではクラス最高の 5pg/uL(dsDNA)の感度を持ちます。低濃度サンプルや構成率の少ないバンドもしっかり検出します。各キットの標準プロトコールは、2uLのサンプル量を必要としますが、1uLに減らすことも可能です。

簡単操作

FragmentAnalyzerはわずかの6ステップで、誰でも簡単に操作可能です。
チップへのゲルの充填など、複雑な作業は必要ありません。

1. 必要量のゲルとインターカレーターを混ぜ、装置にセット
2. 洗浄バッファーボトルを装置にセット
3. 泳動バッファーをプレートに分注し、装置にセット
4. サイズ補正用マーカー溶液とサンプルを96wellプレートに分注し、装置にセット
5. 泳動条件を設定(泳動電圧などの変更も可能)
6. ラン開始

解析ソフトウェア

メイン画面には、仮想ゲルイメージ、エレクトロフェログラム、ピークテーブル等が表示されます。解析パラメータを変更し、オリジナルのサイズ補正マーカーを使用することも可能です。


キャリブレーションカーブ画面では、ラダーマーカーの設定を行います。市販のラダーマーカーへの変更や、過去のラダーデータをインポートすることも可能です。


過去のデータとエレクトロフェログラムを重ね合わせて表示することができます。ライブラリーのアダプターライゲーションの確認等に便利です。


PDF形式でレポートの作成を自動で行います。画像データのコピーやエクセルへのエクスポートも可能です。


専用試薬キット

DNF-900-0500 dsDNA 解析キット, 35-500bp
DNF-910-0500 dsDNA 解析キット, 35-1,500bp
DNF-915-0500 dsDNA 解析キット, 35-5,000bp
DNF-920-0500 dsDNA 解析キット, 75-15,000bp
DNF-930-0500 dsDNA 解析キット, 75-20,000bp
DNF-471-0500 Standard Sensitivity RNA 解析キット
DNF-472-0500 High Sensitivity RNA 解析キット
DNF-470-0275 Small RNA解析キット
DNF-487-0500 Standard Genomic DNA 解析キット
DNF-488-0500 High Sensitivity Genomic DNA 解析キット
DNF-473-0500 Standard Sensitivity NGS解析キット
DNF-474-0500 High Sensitivity NGS 解析キット
DNF-492-0500 Standard Sensitivity Large NGS 解析キット
DNF-493-0500 High Sensitivity Large NGS 解析キット
DNF-464-0500 High Sensitivity Large NGS(>50kbp)解析キット
DNF-480-3000 dsDNA Cleavage Kit (TILLINGキット)

本体仕様

泳動方式 96本 or 12本パラレル型キャピラリー電気泳動
解析サンプル数 最大288サンプル(96ウェルPCRプレート×3枚)/バッチ
泳動スピード 約1時間/96サンプル ※96本ショートキャピラリー装着時
感度 5pg/ul (DNA Fragment)
サイズ正確性 <5%
分離能 ±2 bp (<300 bp)
分画範囲 1~100,000 bp
対応サンプル dsDNA、NGS前処理サンプル、Total RNA、mRNA、
Genomic DNA、Plasmid DNA
分離ゲルの充填 自動充填 (2種類のゲルを自動切換え可能)
必要サンプル量 2ul(推奨) ※1ulでも解析可能
励起光源 1,000 mW LED (470nm)
蛍光検出器 高感度CCDカメラ(500-600nm)
本体サイズ 38cm(W) ×51cm(D)×61cm(H)
本体重量 38.5kg
電源 100-220V 50/60Hz